Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1D9

POLR3F, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3FQ9H1D9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR3FQ9H1D9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms