Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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RAB17Q9H0T7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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RAB17Q9H0T7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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RAB17Q9H0T7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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RAB17Q9H0T7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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RAB17Q9H0T7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB17Q9H0T7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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