Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SENP6Q9GZR1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SENP6Q9GZR1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms