Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
INO80BQ9C086 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INO80BQ9C086 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms