Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM4Q9C037 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM4Q9C037 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM4Q9C037 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM4Q9C037 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM4Q9C037 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM4Q9C037 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM4Q9C037 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM4Q9C037 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM4Q9C037 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM4Q9C037 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM4Q9C037 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms