Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms