Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms