Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7Q9BWT1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms