Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC94Q9BW85 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC94Q9BW85 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms