Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
THUMPD2Q9BTF0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms