Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms