Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRACR2AQ9BSW2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms