Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GINS3Q9BRX5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms