Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIKE1Q9BRV8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIKE1Q9BRV8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIKE1Q9BRV8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIKE1Q9BRV8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIKE1Q9BRV8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIKE1Q9BRV8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SIKE1Q9BRV8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms