Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms