Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLF1Q9BQI6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF1Q9BQI6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms