Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HINFPQ9BQA5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HINFPQ9BQA5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms