Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms