Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3GL3Q99963 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3GL3Q99963 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms