Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3GL2Q99962 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3GL2Q99962 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3GL2Q99962 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms