Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms