Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGRRF1Q99675 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGRRF1Q99675 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms