Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD9AQ99638 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms