Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGMNQ99538 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGMNQ99538 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms