Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY1Q96T51 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms