Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRBNQ96SW2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRBNQ96SW2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms