Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRNP1Q96S65 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRNP1Q96S65 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP1Q96S65 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms