Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERGIC2Q96RQ1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms