Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLIC6Q96NY7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC6Q96NY7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms