Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD6Q96NK8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEUROD6Q96NK8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms