Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT7

CFAP44, Cilia- and flagella-associated protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP44Q96MT7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP44Q96MT7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP44Q96MT7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms