Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms