Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGD4Q96M96 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms