Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00477Q96M19 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00477Q96M19 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms