Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPNS2Q96L46 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
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