Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAX2Q96IS3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms