Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SUCLG2Q96I99 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SUCLG2Q96I99 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms