Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CRELD1Q96HD1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRELD1Q96HD1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms