Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM12Q96EX1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM12Q96EX1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms