Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHFRQ96EP1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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