Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC5Q96DU9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC5Q96DU9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms