Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATG4CQ96DT6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG4CQ96DT6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms