Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OPTNQ96CV9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OPTNQ96CV9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms