Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMIGD2Q96BF3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms