Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPSB1Q96BD6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPSB1Q96BD6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms