Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC74AQ96AQ1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms