Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms