Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX21Q969T3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX21Q969T3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX21Q969T3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms