Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAMP4Q969E2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms