Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP6NLQ92738 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms